Se beneficia de una confluencia mágica de dos climas muy opuestos: el atlántico y el mediterráneo. La imponente Sierra de Cantabria actúa como un muro natural que protege a los viñedos de Rioja Alta y Alavesa de los vientos fríos y húmedos del norte, dándoles un clima más suave y atlántico. A medida que avanzamos hacia la Rioja Oriental, la influencia mediterránea gana la batalla, haciendo que el clima sea más seco, cálido y luminoso.

Dada su gran extensión, los suelos son muy variados dependiendo de la subzona. En Rioja Alavesa y partes de Rioja Alta predominan los excepcionales suelos arcillo-calcáreos (ideales para la elegancia). En otras zonas de Rioja Alta abundan los suelos arcillo-ferrosos (rojizos y ricos en hierro). Por su parte, en Rioja Oriental, situada a menor altitud y más cerca del río, dominan los suelos aluviales, cantos rodados y limos.

Cuenta con un catálogo muy cuidado y estrictamente regulado.

Tintas: La gran reina y espina dorsal de sus vinos es la Tempranillo (ocupa casi el 88% del viñedo tinto). Sus grandes compañeras históricas para los "ensamblajes" (mezclas) son la Garnacha Tinta, la Mazuelo (Cariñena) y la Graciano. También está autorizada la autóctona Maturana Tinta.

Blancas: La uva principal es la Viura (Macabeo). Le acompañan la Malvasía de Rioja y la Garnacha Blanca, además de una curiosa mutación genética natural única en el mundo descubierta en la región: el Tempranillo Blanco. También están autorizadas la Maturana Blanca, Turruntés, Chardonnay, Sauvignon Blanc y Verdejo.